微生物多样性检测(Microbial diversity)
环境微生物多样性检测,是以样品中的微生物群落作为整体进行研究,通过对核糖体RNA高变区域(比如16S/18S/ITS等序列)或功能基因(如古菌的氨氧化基因等)进行PCR扩增和测序,然后分析相应环境下微生物群落的多样性和分布规律。
non-coding RNA测序
贝瑞和康用新一代测序方法进行non-coding RNA分析的优势:1)不依赖参考基因组; 2)更加全面的发现新的非编码RNA;3)能够知道链的方向性。
微生物Meta测序
16S rDNA序列(在所用物种中高度保守)是最常用的细菌分类标准,通过提取环境样品的DNA,并扩增其中16S rDNA基因;通过检测16S rDNA 的序列变异和丰度,反映环境样本中细菌的分类和丰度
酶切建库测序
RAD(restriction site associated DNA)是与限制性核酸内切酶识别位点相关的DNA。RAD-Seq是对酶切获得的标签进行高通量测序,大幅降低基因组的复杂度,操作简便。
高通量测序包RUN
MiSeq测序系统采用Illumina成熟的TruSeq边合成边测序技术,它是唯一一台在单个仪器上整合了扩增、测序和数据分析的新一代测序仪,每次运行最多能产生超过7 Gb的数据。
转录组测序服务
转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA。转录组测序能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息。
细菌基因组测序
新一代高通量测序技术大大减少了基因组测序的成本和时间,让更多实验室可以开展微生物基因组测序项目。根据不同的研究目的和测序要求,细菌基因组测序可分为四种类型:细菌基因组Scanning、细菌基因组
链特异性转录组测序
链特异性转录组测序(strand-specific RNA sequencing)是指在构建测序文库时,利用Illumina高保真Taq酶将mRNA链的方向信息保存到测序文库中。